2016年，中菲爆发南海仲裁争议，时任香港国际仲裁中心主席的郑若骅在研讨会上作总结发言，并就裁决进行深入分析。法律界形容她有魄力，有狠劲。郑若骅就“南海仲裁案”曾表示，根据《联合国海洋法公约》，争议双方应先进行友好协商，而菲律宾未有协商就提请仲裁；此外《公约》还涉及主权国家的保留，因此国际法庭对南海仲裁案并没有管辖权。

此前日本《读卖新闻》报道，有日本研究者认为，中国进行调查活动和申请命名的地点都尽可能地接近日本主张的专属经济区和大陆架。他断言：“这让人感觉中国是有意为之。”但《读卖新闻》也承认，海底地形和命名与国家无关，命名权在于发现者，前提是用于学术研究即可。

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